Man unterscheidet ein dorsales, ein ventrales und zwei kleinere laterale - also insgesamt vier Endokardkissen. Durch Zellproliferation am 23. bis 30. Entwicklungstag engen sie den primitiven Atrioventrikularkanal H-förmig ein. Am Ende der Entwicklung steht die vollständige Trennung in einen linken und einen rechten Atrioventrikularkanal. Dieser Vorgang bildet zusammen mit der anschließenden Septierung von Ventrikel, Atrium und Bulbus cordis wichtige ontogenetische Punkte der Herzentwicklung.
