Bei der Tracheomalazie besteht eine Instabilität der Trachea durch die mangelnde Festigkeit des Knorpels.
Daher ist der Atemwegswiderstand höher als normal, was sich vor allem beim Einatmen bemerkbar macht, da hierbei ein inspiratorischer Unterdruck vorhanden sein muss. Dadurch kollabiert die Luftröhre vor allem beim Einatmen.