Kavitation oder Zystenformation ist zwar genau dokumentiert, aber ungewöhnlich bei einer Pneumocystisinfektion der Lungen. In diesem Bild sieht man eine glattwandige Aushöhlung unter der Pleura. Läsionen dieser Art können durch die viszerlae Pleura brechen und einen Pneumothorax verursachen. Unter dieser Auhöhlung befindet sich eine weitere, größere Aushöhlung mit einem ungleichmäßigen Rand, welche hauptsächlich aus Foamyexudat besteht und die Pneumocystenorganismen enthält. Der Mechanismus der Aushöhlung/Zystenbildung bei einer Pneumocystinfektion wird nicht ganz verstanden.