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Shiga-Toxin ist ein extrem potentes Toxin, das produziert wird, wenn das Bakterium einen Bakteriophage enthält, der das Toxin-Gen trägt. Es ist eng mit dem hämolytisch-urämischen Syndrom und dem akuten Nierenversagen bei Kindern verbunden. Nach der Einnahme über kontaminierte Nahrung oder Wasser besiedeln die E. coli-Bakterien den Darm und produzieren das Gift, das dann die Magen-Darm-Schranke überquert, um in den systemischen Kreislauf zu gelangen und die Niere und andere Zielorgane zu erreichen. In diesem Bild hat sich das Toxin (grün) in den Darm gekreuzt und bindet an die Endothelzellen der Lamina propria (rot).