Sólo los quistes sintomáticos o complicados (hemorragia, infección, rotura, desplazamiento o compresión del sistema de conducto biliar u otros órganos) deben ser tratados. El método más simple es la aspiración guiada por tomografía computarizada del contenido del quiste, posiblemente con la destrucción posterior del quiste con Ethoxysklerol o alcohol. Por desgracia, la tasa de recurrencia de este método es muy alta (hasta 50%).La extirpación quirúrgica del techo del quiste es mucho más eficaz. En 1991, la primera cirugía mínimamente invasiva (laparoscopia) se realizó. En la cirugía mínimamente invasiva el techo del quiste se elimina (después de que el quiste ha vaciado su contenido) a través de tres pequeñas incisiones (umbilical y abdomen media / superior). La cavidad restante se cubre entonces con omento mayor , que se cose al borde del quiste. Esto evita la formación de un quiste nuevo. En comparación con el procedimiento de intervención (punción y la escleroterapia) la cirugía mínimamente invasiva tiene una tasa de recaída mucho menor (11%).
