Los quistes pilonidales son las fístulas causadas por inflamación, que casi siempre se producen por encima de la linea glútea.
La formación de un quiste pilonidal se atribuye a pelos encarnados. Se piensa que pasar mucho tiempo sentado predisponen a las personas a esta condición, ya que aumentan la presión sobre el cóccix, presionando aún más los pelos en la piel y en el tejido subcutáneo. Esto puede dar lugar a granulomas, que pueden infectarse y dar lugar a un absceso. Un conducto sinusal puede provenir de la fuente de infección y salir a la superficie de la piel o ir profundizarse en el tejido.